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氢氧化钙可用作盖髓剂、诱导剂和根管消毒剂。它在牙髓根尖周病治疗中的广泛作用，特别是在儿童年轻恒牙的治疗中，是其他牙髓药物难以替代的。
氢氧化钙根管消毒剂。氢氧化钙作为根管消毒剂，明显优于传统的酚类药物。可杀灭根管内多种细菌，使内毒素失活，并渗入牙本质小管起到杀菌作用，效果明显，刺激性小，无毒性。同时，Ca(OH)2能促进根尖周骨组织的修复和根尖孔的封闭。因此，氢氧化钙已成为治疗年轻恒牙根尖周病非常受关注的根管消毒剂。
能促进根尖组织屏障形成的氢氧化钙制剂，在根尖诱导术中称为诱导剂。诱导剂的作用是消除牙髓、控制根管内的感染，根尖周组织和牙乳头包括残余根尖的炎症，促进和恢复其修复功能，从而达到封闭根尖或保持根尖发育的目的。需要注意的是，在临床应用上有其局限性，氢氧化钙作为诱导剂。应加强根管消毒，对于有根尖周病变的牙齿。只有消除根尖周炎，控制根管感染，氢氧化钙的诱导作用才能有效。
盖髓剂是牙髓表面的所有保护材料或覆盖深孔底部的总称，它不仅能控制牙髓炎，隔离外界刺激，恢复牙髓健康和功能，还能促进牙髓自我修复。其中对机体和牙髓组织无刺激性和毒性的良好的生物相容性，具有促进和诱导修复性牙本质形成的功能，是一种理想的盖髓剂应该具备的条件之一，而氢氧化钙作为盖髓剂则具备这些基本条件。然而，氧化钙作为盖髓剂仍有其局限性。
氢氧化钙药理作用多能诱导根尖闭合，杀菌性能好，消除根管内炎症，杀灭感染根管内微生物，对根尖周组织毒性小，是切根术中根管充填的优选；还能促进碱性磷酸酶活性，促进根尖组织分化，使牙骨质和牙骨质沉积在根管壁上，具有延长根和封闭根尖孔的作用。
氢氧化钙和碘仿均可作为短期和长期封闭药物，充分发挥其药理作用，可有效减少随访次数，缩短疗程，减轻患者痛苦，较其他根管消毒药物更具优势；同时避免了机械和药物刺激引起的治疗后疼痛反应，减少了外部感染的机会，提高了治疗效果。
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